Instituída pela Deliberação CAD-A-01/1999, ficou subordinada à Diretoria Geral de Recursos Humanos (DGRH) até 2003. Tinha como atribuições coordenar, orientar e supervisionar o processo de avaliação de desempenho dos servidores das carreiras de técnicos de apoio administrativo e das carreiras especiais de servidores não-docentes. Também acompanhava o sistema de avaliação de desempenho, propunha planos de desenvolvimento técnico e profissional dos servidores e administrava carreiras não-docentes, bem como a implantação de um sistema de informações para administração de recursos humanos. A CRH foi regulamentada com a implantação da carreira Paepe (Profissionais de Apoio ao Ensino, Pesquisa e Extensão), por meio da Deliberação CAD-A-001/2003 e funcionou por dez anos, quando foi criada a Comissão Central de Recursos Humanos (CCRH).