O Arquivo é composto por documentos textuais, iconográficos, audiovisual e sonoro: correspondências pessoais e oficiais, artigos científicos publicados em livros e publicações seriadas, anotações de pesquisa em mapas e cadernos de campo de reconstrução dos eventos coletados certificados e diplomas artigos sobre o titular fotografias pessoais e de trabalho gravuras, desenhos, mapas. Fazem parte do conjunto, documentos que foram reunidos após seu falecimento. Destaca-se do conjunto geral, o acervo de chapas e filmes de emulsão nuclear, obtidos a partir da detecção dos raios cósmicos recebidas de órgãos estrangeiros (ICEF – International Cooperative Emulsion Flights) desenvolvidos no Mar do Caribe, Berkeley, Guenebra, Oceano Pacífico, e do Laboratório de Chacaltaya - Bolívia, proveniente do convênio firmado entre a Universidade de Campinas e Universidade de San Mayor de San Andrés.

O fundo é composto por processos administrativos, correspondências, documentos especiais, anuários de pesquisa e anuários estatísticos da Unicamp, pareceres, projetos e relatórios de pesquisa, além de dossiês de captação de recursos aos projetos de pesquisa, ensino e extensão

1) MARTINS FILHO, José. Filhos, Amor e Cuidados: Reflexões de um pediatra. Campinas, SP: Papirus, 2000. (02 ex.)
2) MARTINS FILHO, José. Em Defesa das Universidades. Brasília, DF: CRUB, 1997. 72p. (5 ex.)
3) MARTINS FILHO, José. Como e Porque Amamentar. São Paulo, SP: Sarvier, 1984. (02 ex)
4) MARTINS FILHO, José. A Experiência Vivida. A Universidade e Outros Cenários. Campinas, SP: Editora da Unicamp /Pontes, 1998. (04 ex.)
5) ANDRADE, Carlos Baptista de Rossatto, Edson (org). Prática de Escrita: A Crônica: Um Estímulo à Percepção e à Criatividade. São Paulo, SP: Andross, 2005.
6) MARTINS FILHO, José. Lidando com Crianças, Conversando com os Pais – Mais de 700 perguntas que você faria ao pediatra. 2ª edição. Campinas, SP: Papirus, 1995.
7) Calendário de Vacinações do Instituto de Pediatria do Prof. Dr. José Martins Filho e Dr. César A. Amin Sanged. (07ex.)

Processos crimes originados e julgados pelas instâncias da cidade de Campinas por crimes diversificados.

Contém Apelação Crime decorrentes de diversos tipos de processos criminais: Ameaça e Uso de Arma Proibida, Compra Falsa, Contrabando (de homens vendidos como escravos), Cumplicidade em Homicídio, Dano, Estelionato, Ferimento e Ofensa Física, Furto, Homicídio, Homicídio e Defloramento, Homicídio e Roubo, Infração de Postura, Injúria e Ameaça, Ofensa Física, Resistência e Homicídio, Roubo, Tentativa de Homicídio, Ofensa Física e Uso de Arma Proibida, Uso de Título Indevido (exercício ilegal da medicina). Órgãos que iniciaram os processos: Del. de Polícia de Campinas, Juízo de Direito de Campinas e Juízo Municipal de Campinas. Instâncias Julgadoras: Juízo de Direito, Juízo Municipal de Jundiaí, Tribunal de Justiça de São Paulo, Tribunal da Relação de São Paulo, Tribunal da Relação do Distrito, Tribunal da Relação do Rio de Janeiro e Tribunal do Júri.

Contém pedido de apelação crime referente à processo criminal por resistência e homicídio julgado pelo Tribunal da Relação do Rio de Janeiro

Contém pedido de apelação crime referente à processo criminal por contrabando (de homens vendidos como escravos) julgado pelo Tribunal da Relação do Rio de Janeiro

Contém pedidos de apelação crime referentes à processos criminais por infração de postura julgados pelo Juízo de Direito

Contém pedidos de apelação crime referentes à processos criminais por furto julgados por: Juízo de Direito, Tribunal da Relação de São Paulo e Tribunal da Relação do Rio de Janeiro

Contém pedido de apelação crime referente à processo criminal por compra falsa julgado pelo Tribunal da Relação do Rio de Janeiro