A Coordenadoria Geral da Universidade (CGU)foi instituída pelo Decreto Estadual 52.255/69, de 30.07.1969, como previa os Estatutos da Universidade e iniciou suas atividades junto com a própria universidade. Tem a função de promover e coordenar a interação dos projetos e ações administrativas das Pró-Reitorias de Graduação, de Pós-Graduação e de Pesquisa exercer a presidência da Câmara de Administração (CAD) na ausência do reitor presidir a Comissão de Atividades Interdisciplinares (CAI) e coordenar e avaliar em primeira instância as ações administrativas e projetos dos núcleos e centros vinculados à Reitoria.

A Coordenadoria de Serviço Social foi criada pela Portaria GR 77/85, de 15.04.1985, como mecanismo administrativo da Administração Superior da Reitoria, destinada a assegurar a execução integrada dos programas e atividades de assitência dos servidores da Unicamp. Atualmente está subordinada à Pró-Reitoria de Desenvolvimento Universitário, conforme Resolução GR Nº57, de 19.08.2003.

A Coordenadoria de Relações Institucionais e Internacionais (CORI) é um órgão assessor do Gabinete do Reitor e a ele subordinado conforme Resolução GR Nº 57, de 19.08.2003. Criada pela Portaria GR 90/94, de 25.07.1994, substituiu a Assessoria de Relações Internacionais (ARI), criada pela Portaria GR 55/84, de 02.03.1984. A CORI tem por objetivo promover o desenvolvimento de relações institucionais e internacionais da Unicamp. Além de organizada para assessorar a universidade na realização das atividades de cooperação internacional, atualmente vem desenvolvendo um novo projeto de atuação que objetiva a inserção da universidade na comunidade externa, tanto a nível nacional como internacional visando a uma participação mais ampla da universidade nas questões que afetam a sociedade brasileira nos dois níveis mencionados anteriormente, a partir de projetos a serem desenvolvidos em conjunto com instituições governamentais e não governamentais.

A Coordenadoria de Desenvolvimento Cultural (CDC), foi criada pela Portaria GR 44/99, de 08.11.1999, junto à Pró-Reitoria de Extensão e Assuntos Comunitários (PREAC), com o objetivo de implantar e implementar mecanismos efetivos para o desenvolvimento cultural. A CDC substituiu a Assessoria de Apoio a Eventos (APEU) e o Escritório de Ação Cultural (EAC).

Criada pela Deliberação CONSU-A-17/98, de 29.09.1998, como órgão da Reitoria, a Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN) está vinculada à Coordenação Geral da Universidade (CGU), conforme a Resolução GR Nº 57, de 19.08.2003. A COCEN tem por objetivo coordenar as atividades dos Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa, visando à execução da política da administração da universidade para o desenvolvimento desses órgãos.

Prevista nos Estatutos da Unicamp, baixados pelo Decreto Estadual 52.255/69, de 30.07.1969, a Coordenadoria Central de Pós-Graduação (CCPG) tinha como função principal coordenar as atividades dos cursos de pós-graduação. Extinta pelo Decreto Estadual 25.212/86, de 15.05.1986, que alterou os Estatutos da Unicamp, foi substituída pela Pró-Reitoria de Pós-Graduação (PRPG).

O Programa da Moradia Estudantil da Unicamp foi criado pela Portaria GR 55/88, de 01.03.1988 destinado ao atendimento das necessidades de residência dos estudantes de graduação e pós-graduação regularmente matriculados nesta universidade, e dirigido e supervisionado por uma Comissão de Direção Geral do Programa de Moradia Estudantil da Unicamp, criada pela Portaria GR 56/88, de 01.03.1988. Com a Deliberação CONSU-A-04/00, de 22.08.2000, passou a designar Conjunto Residencial Universitário (CRU) que culminou em um conjunto de normas de funcionamento substituindo a antiga comissão por nova coordenadoria, contrariando os interesses dos alunos no que diz respeito a igualdade no poder de decisão dos interesses da moradia. Finalmente foi aprovada a Deliberação CONSU A-24, de 04.12.2001, onde o Programa passou a ter suas regras de funcionamento formailizadas de acordo com as reivindicações dos alunos moradores. Segundo a Portaria GR 198/98, de 30.07.98, o Programa de Moradia Estudantil está subordinada à Pró-Reitoria de Graduação (PRG).