O Centro de Investigação em Pediatria (CIPED) foi criado em outubro de 1997 junto à Faculdade de Ciências Médicas (FCM). Imediatamente após a entrega das instalações físicas, em abril de 1998, vários laboratórios foram progressivamente implantados. Hoje o CIPED aloca nove laboratórios e realiza pesquisas colaborativas com o Hospital de Clínicas (HC), Hospital da Mulher “Professor Doutor José Aristodemo Pinotti” - Centro de Atenção Integral à Saúde da Mulher (CAISM), Centro de Hematologia e Hemoterapia (Hemocentro), Centro de Diagnóstico de Doenças do Aparelho Digestivo (Gastrocentro), Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG), Maternidade de Campinas, Instituto Butantan, Universidade de São Paulo (USP), Universidade Federal de São Paulo, Universidade de Toyama (Japão), Universidade de Massachusetts, Universidade de Chiba (Japão) e Universidade McGill (Canadá). Seu objetivo principal é desenvolver pesquisa básica e aplicada destinada ao estudo das crianças portadoras de leucemias agudas. Hoje, também trabalha na criação de biblioteca celular para estudo da evolução clínica de pacientes leucêmicos.