O Centro de Controle de Intoxicações (CCI) foi criado junto à Reitoria, pela Portaria GR 163/82, de 29.11.1982. Vinculado à Faculdade de Ciências Médicas (FCM), como centro interno de ensino e pesquisa, atua como serviço de apoio ao Hospital das Clínicas (HC), de acordo com a Portaria GR 94/96, de 25.06.1996, que baixou o Regimento Interno do CCI. O Centro de Controle de Intoxicações tem como objetivo principal promover ações, estudos e pesquisas no controle das intoxicações exógenas.