A coleção é composta pelo processo de vida funcional do docente, onde podem ser observados o seu plano de pesquisa intitulado "Demanda de Recursos Minerais no Brasil" e o projeto "Prospectiva Tecnológica para América Latina - Organização das Atividade Iniciais do Instituto de Geociências" os relatórios de atividades e Curriculum Vitae, além de artigos publicados, resumos de artigos apresentados em congressos nacionais e internacionais e certificados de participação em eventos científicos.
1) MARTINS FILHO, José. Filhos, Amor e Cuidados: Reflexões de um pediatra. Campinas, SP: Papirus, 2000. (02 ex.) 2) MARTINS FILHO, José. Em Defesa das Universidades. Brasília, DF: CRUB, 1997. 72p. (5 ex.) 3) MARTINS FILHO, José. Como e Porque Amamentar. São Paulo, SP: Sarvier, 1984. (02 ex) 4) MARTINS FILHO, José. A Experiência Vivida. A Universidade e Outros Cenários. Campinas, SP: Editora da Unicamp /Pontes, 1998. (04 ex.) 5) ANDRADE, Carlos Baptista de Rossatto, Edson (org). Prática de Escrita: A Crônica: Um Estímulo à Percepção e à Criatividade. São Paulo, SP: Andross, 2005. 6) MARTINS FILHO, José. Lidando com Crianças, Conversando com os Pais Mais de 700 perguntas que você faria ao pediatra. 2ª edição. Campinas, SP: Papirus, 1995. 7) Calendário de Vacinações do Instituto de Pediatria do Prof. Dr. José Martins Filho e Dr. César A. Amin Sanged. (07ex.)
O Arquivo é composto por documentos textuais, iconográficos, audiovisual e sonoro: correspondências pessoais e oficiais, artigos científicos publicados em livros e publicações seriadas, anotações de pesquisa em mapas e cadernos de campo de reconstrução dos eventos coletados certificados e diplomas artigos sobre o titular fotografias pessoais e de trabalho gravuras, desenhos, mapas. Fazem parte do conjunto, documentos que foram reunidos após seu falecimento. Destaca-se do conjunto geral, o acervo de chapas e filmes de emulsão nuclear, obtidos a partir da detecção dos raios cósmicos recebidas de órgãos estrangeiros (ICEF International Cooperative Emulsion Flights) desenvolvidos no Mar do Caribe, Berkeley, Guenebra, Oceano Pacífico, e do Laboratório de Chacaltaya - Bolívia, proveniente do convênio firmado entre a Universidade de Campinas e Universidade de San Mayor de San Andrés.
O processo contém documentos relativos aos trâmites administrativos e às atividades docentes desde a sua admissão ao seu desligamento, em que se destacam: os planos de pesquisa intitulados A universidade e o homem: estudo filosófico da antropologia presente nos textos do Ministério da Educação relativos aos cursos de pós-graduação e Filosofia e Psicanálise: a questão do símbolo, curriculum vitae e os relatórios de atividades docentes.
O fundo é composto por processos administrativos, correspondências, documentos especiais, anuários de pesquisa e anuários estatísticos da Unicamp, pareceres, projetos e relatórios de pesquisa, além de dossiês de captação de recursos aos projetos de pesquisa, ensino e extensão
