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Documentos pessoais, correspondência, cartões de Natal e postais, produção intelectual própria e de terceiros, impressos, documentação acadêmica, iconografia, periódicos e objetos.
O FNFM é composto principalmente por cartas trocadas entre colegas, com instituições científicas de pesquisa e ensino, nacionais e internacionais. A correspondência trocada com seu irmão Ademar, também geneticista, envolvem tanto questões familiares quanto profissionais. A correspondência familiar inclui diversas "circulares", com mensagens para vários membros da família em um mesmo item. Há também cartas trocadas entre NFM e padres e religiosos. O FNFM inclui também a sua produção intelectual e sobre ele, diplomas e certificados, relatórios de viagens, currículos, fotografias e vídeos de eventos, entre outros.
O fundo é composto por atos e processos administrativos, publicações, atas e documentos de reuniões, correspondências, projetos e relatórios de pesquisa, livros, etc.