Reúne documentação relacionada com sua trajetória política no movimento estudantil, no Partido dos Trabalhadores e em seus mandatos eletivos. Reúne também documentos sobre os principais movimentos sociais democráticos do período.
Observa-se a existência de dossiês temáticos sobre fatos que tiveram repercussão e abalaram a opinião pública como seqüestros, manifestações, pena de morte, planos econômicos, dívida externa, greves etc.
O fundo documental chegou ao AEL com a seguinte classificação: Arquivo Especial; Arquivo do Mandato Estadual; PT [Partido dos Trabalhadores], Movimento Estudantil, Constituinte, C.E. [Conselho de Ética do PT], Constituinte Federal e Diversos.

A coleção é composta pelo processo de vida funcional, onde podem ser encontrados a listagem de sua produção científica em seu Currículum Vitae.

A coleção é composta pelo processo de contratação.

O conjunto documental corresponde às atividades realizadas pelo Laboratório de Conservação de Órgão da FCM/Unicamp de sua criação a sua extinção (aproximadamente em 2013).
Além disso, o conjunto apresenta uma coleção do docente responsável pelo laboratório, Prof. Dr. José Francisco Figueiredo. Estes documentos correspondem a orientações e pesquisas realizadas enquanto docente e pesquisador de outras instituições de ensino.

A coleção é composta pelo processo de vida funcional e seus anexos denominados comprovantes curriculares, onde podem ser encontrados parte de sua produção científica, em destaque:"Neuronal Ceroid-Lipofuscionosis, a Type of Amaurotic Family Idiocity", "Portuguese Type of Familial Amtyloid Polyneuropathy", "Gioblastoma Multiforme of the Medulla oblangata", entre outros.

A coleção é composta por artigos publicados, anotações pessoais, documentos administrativos, periódicos, memoriais, equipamentos, slides, fotografias, entre outros.

A coleção é composta por trabalhos e textos originais; documentos relacionados à participação em congressos, seminários, cursos, fóruns, entre outros eventos; obras bibliográficas; correspondências recebidas e expedidas; fotografias; documentos relacionados ao ensino como amostras de trabalhos, avaliações de curso, ementas e cronogramas, plano de cursos, planos de trabalho, materiais de apoio didático e slides; fitas VHS e Cassete; reportagens em jornais sobre o Dr. José Martins Filho; documentos do Centro de Investigação em Pediatria (CIPED); documentos da FCM/UNICAMP; trabalhos com dedicatória em manuscrito; entre outros.

1) MARTINS FILHO, José. Filhos, Amor e Cuidados: Reflexões de um pediatra. Campinas, SP: Papirus, 2000. (02 ex.)
2) MARTINS FILHO, José. Em Defesa das Universidades. Brasília, DF: CRUB, 1997. 72p. (5 ex.)
3) MARTINS FILHO, José. Como e Porque Amamentar. São Paulo, SP: Sarvier, 1984. (02 ex)
4) MARTINS FILHO, José. A Experiência Vivida. A Universidade e Outros Cenários. Campinas, SP: Editora da Unicamp /Pontes, 1998. (04 ex.)
5) ANDRADE, Carlos Baptista de Rossatto, Edson (org). Prática de Escrita: A Crônica: Um Estímulo à Percepção e à Criatividade. São Paulo, SP: Andross, 2005.
6) MARTINS FILHO, José. Lidando com Crianças, Conversando com os Pais – Mais de 700 perguntas que você faria ao pediatra. 2ª edição. Campinas, SP: Papirus, 1995.
7) Calendário de Vacinações do Instituto de Pediatria do Prof. Dr. José Martins Filho e Dr. César A. Amin Sanged. (07ex.)

A coleção constitui uma das mais importantes bibliotecas com publicações anteriores a 1801 relativas aos países latinos americanos, especialmente México (900 livros), Peru (240), Guatemala (140), e Espanha (400 títulos sobre as Américas). As obras refletem o interesse do titular, cujos temas abordam assuntos de governo, urbanização, cultura, religião, eventos, personalidades diversas, inquisição etc.