Instituído pela Portaria GR-140/1974, o Centro de Estudos de Problemas Brasileiros (CEPB) tinha por objetivos realizar pesquisas nas diferentes áreas de conhecimento, oferecer serviços à comunidade e realizar cursos em todos os níveis de estudo de problemas brasileiros. O CEPB foi extinto pela Deliberação CONSU-A-002/1994.

O Centro de Informática Aplicada (CEINFO) foi criado junto à Reitoria por meio da Portaria GR-124/1985 para coordenação e integração das atividades do Núcleo de Informática Aplicada à Educação (NIED), Núcleo de Informática Biomédica (NIB) e Núcleo de Automação Industrial (NAI). O CEINFO foi extinto pela Portaria GR-127/1986.

Constituído pela Portaria GR-036/1989, o Núcleo de Ciência, Aplicações e Tecnologias Espaciais (NUCATE) foi resultado da transformação do antigo Núcleo de Pesquisas e Estudos de Imagens (NUPIM), que havia sido criado pela Portaria GR-157/1985. De acordo com a Deliberação CONSU-A-017/1998, passou a ser subordinado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). Conforme o regimento interno, disposto na Deliberação CONSU-A-25/1991, seus objetivos eram coordenar, realizar e/ou participar de atividades interdisciplinares de ensino, pesquisa, desenvolvimento e serviços nas áreas de ciência, aplicações e tecnologia aeroespaciais e correlatas.

Criado pela Portaria GR-025/1982, o Núcleo de Estudo e Pesquisas Multidisciplinares (NEPM) estava destinado a contribuir, mediante observações, nos estudos e pesquisas multidisciplinares em todos os ramos do conhecimento, para a melhor compreensão dos fenômenos naturais e aplicação prática de suas leis.

O Núcleo de Estudos Amazônicos (NEA) foi criado junto à Reitoria por meio da Portaria GR-087/1985, destinado a coordenar o incentivo, apoio e promoção da pesquisa científica e tecnológica sobre a Amazônia, de modo a estimular a cooperação interdisciplinar no âmbito da Unicamp e a facilitar a interação com outras instituições de pesquisa. O NEA não chegou a ser implantado.

O Núcleo de Estudos Constitucionais (NEC) foi criado em 1987 pela Deliberação CONSU-A-006/1987. Vinculado à Reitoria, tinha o objetivo de promover a mobilização da capacidade científica da Unicamp para o estudo de temas constantes da pauta da Assembleia Nacional Constituinte, visando fornecer subsídios para tomadas de decisão dos constituintes, incorporação da Unicamp ao esforço conjunto das universidades brasileiras em direção ao debate nacional sobre a Constituinte, análise do Congresso e da nova Constituição, além da realização de eventos científicos. O NEC foi extinto pela Deliberação CONSU-410/1995.

O Núcleo de Estudos de Direito Educacional (NEDE) foi criado pela Portaria GR-017/1985 e era diretamente subordinado à Reitoria. Teve como objetivos manter atualizado o acervo de legislação e jurisprudência sobre educação e ensino, bem como obras, documentos, informações e referências sobre o fato educacional nas suas diversas manifestações, realizar estudos e eventos sobre política e direito educacional comparado e proporcionar subsídios jurídico-educacionais para tomada de decisões. O NEDE foi extinto pela Deliberação CONSU-172/1990, conforme Relatório de Avaliação dos Núcleos e Centros de 1988, apresentado pela Comissão de Atividades Interdisciplinares (CAI).

O Núcleo de Estudos e Pesquisas em Automação Industrial foi criado como órgão complementar, subordinado à Reitoria, por intermédio da Portaria GR-293/1983. De acordo com a Portaria GR-068/1984, que define sua estrutura e seus objetivos, o NAI promoveria estudos e pesquisas interdisciplinares em todos os campos relacionados com a automação de processos industriais e suas implicações tecnológicas, econômicas, sociais e humanas. Como atribuição, o NAI também deveria promover a conexão entre a Unicamp e órgãos governamentais, instituições de ensino e centros de pesquisa. Foi extinto em 1990, por meio da Deliberação CONSU-172/1990, conforme Relatório de Avaliação dos Núcleos e Centros de 1988, apresentado pela Comissão de Atividades Interdisciplinares (CAI).

CInstituído pela Portaria GR-059/1985, o Núcleo de Estudos Estratégicos (NEE) foi criado para promover estudos e pesquisas interdisciplinares sobre o aparelho militar, questões de estratégia e relações internacionais. De acordo com a Deliberação CONSU-A-010/1993, que alterou o regimento interno do órgão, suas atividades se concentraram nas áreas de Forças Armadas e Estado, Estratégica e Política Internacional. A partir de 1998, passou a compor a Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). De acordo com a Deliberação CONSU-A-007/2002, que dispôs sobre o regimento interno, seus objetivos naquele momento seriam baseados na divulgação de conhecimentos e participação em debates nacionais sobre a história dos exércitos e da guerra, estratégia, defesa nacional e relações de força no plano internacional. Foi extinto pela Deliberação CONSU-347/2009.

O Núcleo de Estudos Regionais (NER) foi criado pela Portaria GR-348/1985, diretamente subordinado à Reitoria e integrado ao Centro de Memória Unicamp (CMU). Tinha por finalidade a realização e divulgação de pesquisas e estudos de natureza interdisciplinar. Suas atividades eram desenvolvidas a partir dos fundos documentais que compõem o acervo do CMU, privilegiando como objeto de estudo a região historicamente conhecida como Oeste Paulista. Em 1990 foi aprovada sua fusão com o CMU por meio da Deliberação CONSU-172/1990.