O Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA) foi criado pela Portaria GR-351/1986. Tem um papel de grande importância no cenário científico nacional, sendo considerado uma referência em produtos naturais, biotecnologia e meio ambiente. Oferece serviços analíticos e de consultoria, que englobam desde análises pontuais até o desenvolvimento de processos e produtos, com patentes depositadas e licenciadas pelo corpo de pesquisadores. O centro também proporciona estágios e orientações a alunos de pós-graduação.

O Centro de Lógica, Epistemologia e História da Ciência (CLE) foi criado pela Portaria GR-038/1977. Conforme a Deliberação CONSU-A-10/2002, que dispõe sobre o seu regimento, o CLE tem como objetivos promover e incentivar pesquisas, publicações, seminários, colóquios e preservação de acervos ligados às áreas de atuação do centro, cujos pesquisadores se dedicam aos estudos de lógica, racionalidade, epistemologia e história da ciência. Essa área da filosofia é interdisciplinar e base para outras ciências e produção do conhecimento.

O Centro de Lógica, Epistemologia e História da Ciência (CLE) foi criado pela Portaria GR-038/1977. Conforme a Deliberação CONSU-A-10/2002, que dispõe sobre o seu regimento, o CLE tem como objetivos promover e incentivar pesquisas, publicações, seminários, colóquios e preservação de acervos ligados às áreas de atuação do centro, cujos pesquisadores se dedicam aos estudos de lógica, racionalidade, epistemologia e história da ciência. Essa área da filosofia é interdisciplinar e base para outras ciências e produção do conhecimento.

O Centro de Integração, Documentação e Difusão Cultural (CIDDIC) foi criado a partir da fusão entre o Núcleo de Integração e Difusão Cultural (NIDIC) e o Centro de Documentação de Música Contemporânea (CDMC). O órgão foca as atividades em música contemporânea, principalmente no repertório produzido por compositores brasileiros dos séculos XX e XXI. A proposta do centro é intensificar tanto a execução quanto a pesquisa de obras desta área. As atividades da Orquestra Sinfônica da Unicamp (OSU), do Coral Unicamp Zíper na Boca e da Escola Livre de Música (ELM) também foram incorporadas ao CIDDIC. Ao longo de sua história, o NIDIC teve como objetivos gerais promover e desenvolver as artes e a cultura na Universidade, produzindo e transmitindo conhecimentos musicais à comunidade interna e externa. Foi composto pelos projetos Unibanda, Orquestra Infanto-Juvenil da Unicamp, Coral Unicantus (Coral Infanto-Juvenil), Coral Unicamp Zíper na Boca e Orquestra Sinfônica da Unicamp, entre outros grupos de música de câmara. O CDMC foi criado em Campinas, por meio de convênio entre a Unicamp e o Centre de Documentation de la Musique Contemporaine. Tinha como objetivos a documentação, divulgação e promoção da música contemporânea de vanguarda, além de prestar consultoria e assessoria para pesquisadores e entidades internacionais. Os objetivos do CIDDIC, por sua vez, segundo a Deliberação CONSU-A-009/2014, são: constituir acervo documental e artístico, divulgar e promover a música contemporânea, promover a integração cultural e artística na Universidade e desenvolver projetos de pesquisa e pedagógicos.

O Centro de Estudos de Opinião Pública (CESOP) é um núcleo de pesquisa interdisciplinar estabelecido pela Deliberação CONSU-A-15/1992, inicialmente vinculado à Pró-Reitoria de Desenvolvimento Universitário (PRDU). Tem como objetivo o desenvolvimento da pesquisa científica no campo do comportamento político e social e, nesse sentido, busca a consolidação de uma estrutura para organização, preservação, consulta e divulgação de dados. Dessa forma, promove o aproveitamento dos dados disponíveis por meio de análises e pesquisas teóricas e metodológicas.

Inicialmente denominado Centro de Engenharia do Petróleo, foi criado junto à Reitoria, através da Portaria GR-059/1987 e, dois anos depois, passou a ter a atual denominação. Atualmente é vinculado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). O CEPETRO teve início por meio de uma parceria entre Unicamp e Petrobras devido uma demanda crescente por pesquisas na área de petróleo. Desta parceria também nasceu o Departamento de Engenharia do Petróleo (DEP) na Faculdade de Engenharia Mecânica (FEM). Em 1990 criou-se o programa de mestrado em Geoengenharia de Reservatórios de Petróleo no Instituto de Geociências (IG), seguido do programa de doutorado. O CEPETRO promove pesquisas científicas e tecnológicas próprias ou em convênio com outras instituições, nas áreas de exploração petrolífera e geoengenharia de reservatórios petrolíferos, engenharia de reservatórios, perfuração e contemplação de poços, produção petrolífera e gestão de recursos petrolíferos e processamento sísmico, incentivo e colaboração para promover e realizar cursos de pós-graduação e extensão universitária, além de eventos como semanas de estudos, seminários, colóquios, conferências, publicações e intercâmbio científico com instituições nacionais e estrangeiras.

Previsto nos Estatutos da Unicamp, baixados pelo Decreto Estadual 52.255/1969, o Biotério Central da Unicamp foi inaugurado em 15/02/1979. Teve o seu primeiro regimento aprovado, por intermédio da Deliberação CONSU-A-009/1987, na ocasião era um órgão complementar da Universidade, subordinado ao Instituto de Biologia (IB). O biotério funcionou como uma unidade básica de produção de animais por algum tempo, mas as necessidades da comunidade científica da Unicamp cresciam. Após passar por reformas e adequações, foi denominado Centro de Bioterismo (CEMIB), através da Deliberação CONSU-A-31/1989, que o vinculou à Reitoria e, em 1998, passou à subordinação da COCEN. Pesquisadores do CEMIB atuam em investigações biológicas na área de ciência de animais de laboratórios, integrando recursos humanos e materiais para a formação de pessoal especializado. Produzem matrizes selecionadas e certificadas de camundongos e ratos, do ponto de vista genético, sanitário e ambiental, para atender a demanda de biotérios nacionais encarregados da produção de animais de experimentação.

O CEB foi criado pela Portaria GR-133/1982 com intuito de congregar esforços em ensino e pesquisa em engenharia biomédica que já existiam na Unicamp. De acordo com o seu regimento, disposto na Deliberação CONSU-A-16/2001, são objetivos gerais a realização de pesquisa básica e aplicada, prestação de serviços e suporte ao ensino, visando ao aprimoramento contínuo de recursos humanos e processos em ciência, engenharia e tecnologia biomédica específicos do CEB, desenvolvimento de estudos de fenômenos e sistemas biológicos, avaliação de dispositivos e equipamentos para uso odonto-médico-hospitalar, assessoria de instituições e profissionais sobre especificação, aquisição, avaliação, instalação, manutenção e desativação de equipamentos.

O Centro de Componentes Semicondutores e Nanotecnologias (CCSNano) foi criado pela Portaria GR-019/1981, a partir do Laboratório de Eletrônica e Dispositivos (LED). De acordo com a Deliberação CONSU-A-13/2002, tem como objetivos: realização de pesquisa básica e aplicada, suporte ao ensino, visando o aprimoramento contínuo de recursos humanos e processos na área de microeletrônica. Pesquisadores desenvolvem pesquisa quantitativa, básica e aplicada em microeletrônica, microssistemas, micro e nanofabricação, compreendendo os dispositivos semicondutores, circuitos integrados, insumos e equipamentos de produção. Também assessoram instituições e profissionais na aquisição, instalação, manutenção e desativação de processos e equipamentos de microeletrônica e fotônica.

O Centro de Biologia Molecular e Engenharia Genética (CBMEG) foi criado pela Portaria GR-388/1986. Seu corpo de pesquisadores atua no desenvolvimento de pesquisas nos campos da genética animal, vegetal, humana e de microrganismos, além de projetos em genômica estrutural, funcional e comparativa. De acordo com a Deliberação CONSU-A-020/2001, que dispõe sobre o seu regimento, tem por objetivos: realizar e divulgar, por meio de publicações de artigos científicos originais em revistas indexadas nacionais e estrangeiras, pesquisa científica nas áreas de Biologia Molecular, Engenharia Genética, Ciências Moleculares e áreas correlatas, prestar serviços e oferecer treinamento, através da participação de seus pesquisadores em cursos de pós-graduação, extensão universitária, especialização, orientação de estudantes de iniciação científica, aperfeiçoamento, estágios, intercâmbio científico com outras unidades da Unicamp e instituições nacionais e estrangeiras.