Prevista nos Estatutos da Unicamp de 1969, a Faculdade de Engenharia Agrícola (FEAGRI) foi implantada a partir da criação do curso de Engenharia Agrícola da então Faculdade de Engenharia de Alimentos e Agrícola (FEAA), de acordo com o Decreto Estadual 7.342/1975, que deu origem ao Departamento de Engenharia Agrícola. Posteriormente, com a publicação do Decreto 23.646 de 1985, foram alterados os Estatutos e o Regimento Geral da Unicamp, desmembrando-se a Faculdade de Engenharia de Alimentos e Agrícola em duas outras: a Faculdade de Engenharia de Alimentos (FEA) e a Faculdade de Engenharia Agrícola (FEAGRI). Além da graduação, a unidade oferece cursos de pós-graduação, disciplinas de extensão e cursos de especialização, além de promover atividades de pesquisa científica e tecnológica, colaborar com programas educativos e prestação de serviços técnicos e científicos.

O curso de graduação em Engenharia Civil, autorizado a funcionar por intermédio da Resolução CEE 04/1969, foi inicialmente ministrado na extinta Faculdade de Engenharia de Limeira (FEL), incorporada à Unicamp em 1969. Em agosto de 1968, ocorreu a doação de uma área de cinquenta mil metros quadrados em Limeira-SP pela família Ometto à Unicamp. Enquanto os edifícios eram construídos, os alunos utilizavam o Ginásio Estadual Industrial Trajano Camargo para aulas específicas e o campus de Campinas para as disciplinas básicas. Em 1988, foi aprovada a transferência do curso para Campinas, ao passo que foi criado o Centro Superior de Educação Tecnológica (CESET), conforme a Deliberação CONSU-A-19/1988. Já em Campinas, a FEL passou a ser denominada Faculdade de Engenharia Civil (FEC). Em 1999, teve início o curso de graduação em Arquitetura e Urbanismo, de acordo com a Deliberação CONSU-A-15/1997. A unidade, em 2013, passou a se chamar Faculdade de Engenharia Civil, Arquitetura e Urbanismo (FECFAU).

IInicialmente denominada Faculdade de Tecnologia de Alimentos (FTA), teve autorização para instalação e funcionamento por meio da Resolução CEE 46/1966. Iniciou suas atividades em 1967 no Instituto de Tecnologia de Alimentos (ITAL). Em 1972, o curso foi transferido para o campus da Unicamp. A partir do Decreto Estadual 7.342/1975, a unidade foi denominada Faculdade de Engenharia de Alimentos e Agrícola (FEAA), em decorrência da criação do curso de Engenharia Agrícola. Dez anos depois, com a publicação do Decreto Estadual 23.646/1985, a FEAA desdobrou-se, dando origem à Faculdade de Engenharia de Alimentos (FEA) e à Faculdade de Engenharia Agrícola (FEAGRI). A FEA tem como principal objetivo formar profissionais capacitados para atender as exigências técnico-científicas da agroindústria e das entidades de ensino e pesquisa. Atualmente é composta pelos Departamento de Ciência de Alimentos e Nutrição e Departamento de Engenharia e Tecnologia de Alimentos.

A Faculdade de Engenharia de Campinas (FEC) teve autorização para a sua instalação e funcionamento por meio da Resolução CEE 46/1966. Em 1969, já funcionava com os cursos de Engenharia Mecânica e de Engenharia Elétrica e, em 1975, abrangia também o de Engenharia Química. Mais tarde, esses cursos se tornaram unidades autônomas: Faculdade de Engenharia Elétrica (FEEC) em 1986, Faculdade de Engenharia Mecânica (FEM) e Faculdade de Engenharia Química (FEQ), em 1989. Desde então, a Faculdade de Engenharia de Campinas (FEC) foi extinta.

A instalação e o funcionamento da Faculdade de Engenharia de Limeira (FEL) foi autorizada pela Resolução CEE 46/1966. O curso de graduação em Engenharia Civil teve início em 1969. Porém, por meio da Deliberação CONSU-A-019/1988, o curso foi transferido para o campus de Campinas. Em Limeira, foi criado o Centro Superior de Educação Tecnológica (CESET) pela mesma deliberação. Com relação à FEL, passou a denominar-se Faculdade de Engenharia Civil (FEC), de acordo com a Deliberação CONSU-A-019/1990.

Foi criada pelo Decreto Estadual 25.783/1986, a partir do desmembramento da Faculdade de Engenharia de Campinas (FEC) que mantinha, desde 1967, o curso de graduação em Engenharia Elétrica, de acordo com a Resolução CEE 46/1966. A Faculdade de Engenharia Elétrica (FEE) alterou o nome para Faculdade de Engenharia Elétrica e de Computação (FEEC), a partir da Deliberação CONSU-A-04/1996, quando também passou a oferecer, em parceria com o Instituto de Computação (IC), o curso de graduação em Engenharia de Computação. De acordo com a Deliberação CONSU-A-031/2013, que dispõe sobre seu regimento interno, a FEEC tem por finalidade formar profissionais, ministrar cursos, realizar pesquisas científicas e tecnológicas e prestar serviços à sociedade nas áreas de Engenharia Elétrica, Engenharia de Computação e áreas multidisciplinares. A unidade divide-se em quatro departamentos: Departamento de Engenharia de Computação e Automação Industrial, Departamento de Engenharia Biomédica, Departamento de Comunicações, Departamento de Sistemas e Energia.

A Faculdade de Engenharia Mecânica (FEM) teve origem a partir do desmembramento da Faculdade de Engenharia de Campinas (FEC), pela Deliberação CONSU-A-24/1989, que ministrava o curso de Engenharia Mecânica desde 1967. De acordo com a Deliberação CONSU-A-032/2013, que dispõe sobre seu regimento interno, a FEM forma profissionais dos diversos ramos de Engenharia Mecânica e Engenharia de Controle e Automação (Mecatrônica), realiza pesquisas científicas e tecnológicas e presta serviços à comunidade. A pós-graduação teve início em meados da década de 1970. Dentre os cursos de pós-graduação destaca-se também a modalidade Mestrado Profissional, visando a formação de recursos humanos ligados ao setor produtivo. Em 1998, entrou em funcionamento, no período noturno, o curso de Engenharia de Controle e Automação.

A FEQ Iniciou-se com o curso de graduação em Engenharia Química, vinculado ao Departamento de Engenharia Química da então Faculdade de Engenharia de Campinas (FEC), em 1975. Assim, como a própria Faculdade de Engenharia Química, que foi criada pela Deliberação CONSU-A-24/1989, o curso de pós-graduação em nível de mestrado teve início em março de 1980 e o programa de doutorado em Engenharia Química, em 1989. As atividades de pesquisa tiveram início em 1976 com a proposta do Projeto Hidrogênio, inserido em um amplo programa de pesquisa em energias alternativas. Com esses recursos, foram montados os primeiros laboratórios e lançadas as bases da área de Desenvolvimento de Processos, a qual viria a caracterizar inicialmente as atividades de pós-graduação. De acordo com a Deliberação CONSU-A-026/2002, a FEQ tem por objetivos formar profissionais, realizar
pesquisas científicas e tecnológicas, além de prestar serviços à comunidade na área de Engenharia Química.