O Núcleo de Estudos de Direito Educacional (NEDE) foi criado pela Portaria GR-017/1985 e era diretamente subordinado à Reitoria. Teve como objetivos manter atualizado o acervo de legislação e jurisprudência sobre educação e ensino, bem como obras, documentos, informações e referências sobre o fato educacional nas suas diversas manifestações, realizar estudos e eventos sobre política e direito educacional comparado e proporcionar subsídios jurídico-educacionais para tomada de decisões. O NEDE foi extinto pela Deliberação CONSU-172/1990, conforme Relatório de Avaliação dos Núcleos e Centros de 1988, apresentado pela Comissão de Atividades Interdisciplinares (CAI).

A jornalista e escritora Patrícia Galvão, a “Pagu”, uma das mulheres mais ativas no movimento modernista nos anos 1920 e 1930, deu nome ao Núcleo de Estudos de Gênero da Unicamp (PAGU), instituído em 1993, por meio da Deliberação CONSU-A-14/1993, como resultado do trabalho de pesquisadoras inseridas em campos disciplinares distintos que buscavam dialogar com as teorias feministas e de gênero. O trabalho começou em 1991 como um centro de estudos, sediado no Instituto de Filosofia e Ciências Humanas (IFCH). Atualmente subordinado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN), tem a interdisciplinaridade como marca de suas pesquisas e divulgações, focadas no conceito de gênero, no âmbito das ciências sociais, econômicas, antropológicas, históricas e políticas. O PAGU realiza pesquisas próprias ou em convênio com outras instituições e colabora nos programas de pesquisa e extensão das unidades e demais órgãos da Universidade.

A Portaria GR-28/1982 criou o Núcleo de Estudos de População (NEPO) e consolidou-se com a Deliberação CONSU-A-29/1991, que diz respeito ao seu regimento interno. Atualmente está vinculado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). Segundo a Deliberação CONSU-A-034/2013, são objetivos principais do NEPO realizar pesquisas próprias ou em convênio com outras instituições e colaborar com cursos de graduação, pós-graduação, especialização, extensão e treinamentos. Produz e divulga conhecimentos nas áreas de População e Demografia, a partir de uma perspectiva interdisciplinar. Alguns exemplos de linhas de pesquisa são: demografia e etnias, demografia e políticas sociais, família, gênero e população, redistribuição espacial da população, população, saúde e ambiente, saúde reprodutiva e sexualidade.

Criado pela Portaria GR-110/1982 junto à Reitoria, com a denominação de Núcleo de Ecologia Humana (NEH), teve a atualização de sua denominação para Núcleo de Estudos Ambientais (NEPAM), segundo a Portaria GR-289/1987. Atualmente está subordinado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN), conforme a Deliberação CONSU-A-002/2015, com proposta de abordagem teórica, prática e pluralista, com enfoque nas questões ambientais.Desenvolve projetos de pesquisas que tratam da interação ambiente e sociedade, participa da formação de estudantes em várias unidades da Unicamp, bem como com outras instituições de ensino nacionais ou internacionais. Pesquisadores também realizam consultoria a entidades governamentais, publicações regulares e atividades de extensão.

Criado junto à Reitoria pela Portaria GR-110/1983, o Núcleo de Estudos e Pesquisas em Alimentação (NEPA) está atualmente subordinado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN), de acordo com a Deliberação CONSU-A-044/2019. Entre os objetivos do núcleo, estão: desenvolver pesquisas multidisciplinares na área de Alimentação, sob os pontos de vista de produção, distribuição e consumo de alimentos, nutrição, segurança alimentar, na interface com o campo da saúde, cujos resultados possam servir de forma direta ou indireta como subsídios à atuação de órgãos públicos federais, estaduais e municipais. Pesquisadores do NEPA produzem e divulgam conhecimentos, como legislação e rotulagem e tecnologias no setor de alimentos.

O Núcleo de Estudos e Pesquisas em Automação Industrial foi criado como órgão complementar, subordinado à Reitoria, por intermédio da Portaria GR-293/1983. De acordo com a Portaria GR-068/1984, que define sua estrutura e seus objetivos, o NAI promoveria estudos e pesquisas interdisciplinares em todos os campos relacionados com a automação de processos industriais e suas implicações tecnológicas, econômicas, sociais e humanas. Como atribuição, o NAI também deveria promover a conexão entre a Unicamp e órgãos governamentais, instituições de ensino e centros de pesquisa. Foi extinto em 1990, por meio da Deliberação CONSU-172/1990, conforme Relatório de Avaliação dos Núcleos e Centros de 1988, apresentado pela Comissão de Atividades Interdisciplinares (CAI).

CInstituído pela Portaria GR-059/1985, o Núcleo de Estudos Estratégicos (NEE) foi criado para promover estudos e pesquisas interdisciplinares sobre o aparelho militar, questões de estratégia e relações internacionais. De acordo com a Deliberação CONSU-A-010/1993, que alterou o regimento interno do órgão, suas atividades se concentraram nas áreas de Forças Armadas e Estado, Estratégica e Política Internacional. A partir de 1998, passou a compor a Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). De acordo com a Deliberação CONSU-A-007/2002, que dispôs sobre o regimento interno, seus objetivos naquele momento seriam baseados na divulgação de conhecimentos e participação em debates nacionais sobre a história dos exércitos e da guerra, estratégia, defesa nacional e relações de força no plano internacional. Foi extinto pela Deliberação CONSU-347/2009.

Criado pela Portaria GR-048/1984 e subordinado à Reitoria, o Núcleo de Estudos Psicológicos (NEP) foi instituído para promover estudos, pesquisas e verificação experimental e teórica em todos os campos relacionados com as Ciências Psicológicas. Foi extinto pela Deliberação CONSU-176/1996.

O Núcleo de Estudos Regionais (NER) foi criado pela Portaria GR-348/1985, diretamente subordinado à Reitoria e integrado ao Centro de Memória Unicamp (CMU). Tinha por finalidade a realização e divulgação de pesquisas e estudos de natureza interdisciplinar. Suas atividades eram desenvolvidas a partir dos fundos documentais que compõem o acervo do CMU, privilegiando como objeto de estudo a região historicamente conhecida como Oeste Paulista. Em 1990 foi aprovada sua fusão com o CMU por meio da Deliberação CONSU-172/1990.

No momento em que os computadores entravam nas escolas de ensino fundamental e médio do país, a criação do Núcleo de Informática Aplicada à Educação (NIED) aconteceu pela Portaria GR-139/1983. O NIED foi institucionalizado através da Deliberação CONSU-A-31/1991 e está atualmente vinculado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN). As pesquisas sempre acompanharam todo o avanço e ações da informática no Brasil, com foco na aplicação de tecnologias de informática e comunicação voltadas para contextos de ensino-aprendizagem presencial e remoto. Kits pedagógicos, acessibilidade, robótica pedagógica com custo acessível, educação à distância sempre estiveram no escopo do NIED, por meio de projetos como Educom, Teleduc, Ambiente Lego-Logo, Dafe, Tidia-Ae, Time, E-Cidadania e Mapa Tátil Sonoro (MTS).