Inicialmente denominada Faculdade de Tecnologia de Alimentos (FTA), teve autorização para instalação e funcionamento por meio da Resolução CEE 46/66, de 19.12.1966. O primeiro curso, Tecnologia de Alimentos, teve início em 1967 no Instituto de Tecnologia de Alimentos (ITAL). Em 1972, o curso e a unidade foram transferidos para o campus da Unicamp. Com o Decreto Estadual 7.342/75, de 22.12.1975, a unidade passou a denominar-se Faculdade de Engenharia de Alimentos e Agrícola (FEAA), com os cursos de Engenharia de Alimentos e Engenharia Agrícola. Posteriormente, pelo Decreto Estadual 23.646/85, de 10.07.1985, a FEAA desdobrou-se dando origem à Faculdade de Engenharia de Alimentos (FEA), com o curso de Engenharia de Alimentos, e à Faculdade de Engenharia Agrícola (FEAGRI), com o curso de Engenharia Agrícola. A FEA tem como principal objetivo formar profissionais capacitados para atender as exigências técnico-científicas da agro-indústria e das entidades de ensino e pesquisa.