A coleção é composta por diversos documentos do CCI. Entre eles estão: Provas de seleção para estágio remunerado, fichas de notificação de intoxicação de pacientes, livros de registro de atendimento, fichas de atendimento de pacientes intoxicados por animais peçonhentos, regimento e deliberações do CCI, funciograma e responsabilidades, plantas e ofício de criação do CCI, produção científica do CCI, relatórios de gestão da coordenação, relatório do grupo de estudos epidemiológicos em Toxicologia, relatório do grupo de estudos epidemiológicos em toxicologia, relatório de atividades do laboratório, relatório Sinitox, atas e pautas dos conselhos técnico e técnico científico, relatórios de atividades do CCI, certificados e honrarias, reportagens na imprensa sobre o CCI, dossiê de cursos realizados pelo CCI, projetos/convênios, ficha de profilaxia da raiva, entre outros.

A coleção é composta pelos seguintes documentos: programa de disciplinas, catálogo de graduação, arquivos de reuniões do curso de medicina, regimento geral dos cursos de graduação, Revista da Faculdade de Ciências Médicas, manifesto internato consciente, boletim de notas e frequência, comissão especial averiguação trote, relatório final de avaliação institucional Unicamp, dossiê Programa de Estágio Docente - PED, avaliação discente, provas do curso de medicina, correspondências recebidas e expedidas, programa de Iniciação Científica, textos didáticos sobre ensino, atualização de catálogos e ementa disciplinar, arquivos GREA, relatórios de projetos, listas de presença e atas de reunião da CEG, dossiê CAAL, palestras, portarias, deliberações, resoluções, fotos, entre outros.

O conjunto é composto por correspondências relacionadas à secretaria administrativa, resumos e apresentações de aulas, projetos para aulas, provas de graduação, questionários de avaliação docente, prova de seleção de residente, processos de concursos de docentes, entre outros.

O conjunto é composto por amostras de provas relacionadas à DPC.

O conjunto é composto por diversos documentos relacionados ao DPMS. Entre eles estão documentos de setores do departamento que realizam atendimentos médicos (atas de reunião, regimentos internos, relatórios de atendimentos, registros de frequência dos funcionários, prontuários de pacientes, agendas, entre outros), documentos relacionados à Secretaria de Residência Médica e Extensão (documentos sobre cursos, apresentações e treinamentos), e documentos da Secretaria de Ensino de Graduação (amostra de provas, documentos sobre aulas, avaliação de docentes, fitas cassetes de aulas), entre outros.

A coleção é composta por trabalhos e textos originais; documentos relacionados à participação em congressos, seminários, cursos, fóruns, entre outros eventos; obras bibliográficas; correspondências recebidas e expedidas; fotografias; documentos relacionados ao ensino como amostras de trabalhos, avaliações de curso, ementas e cronogramas, plano de cursos, planos de trabalho, materiais de apoio didático e slides; fitas VHS e Cassete; reportagens em jornais sobre o Dr. José Martins Filho; documentos do Centro de Investigação em Pediatria (CIPED); documentos da FCM/UNICAMP; trabalhos com dedicatória em manuscrito; entre outros.

O conjunto reúne diversos equipamentos médicos, como Eletrocardiograma e Stimulator, correspondências, relatórios de atividades, artigos científicos, cadernos de anotações, livros, resultados de experimentos e estudos, manuscritos, teses, manuais, cadernos de aulas, memoriais, entre outros.

A coleção reúne documentos de organizações de esquerda às quais Gilberto Mathias esteve ligado e que atuaram na clandestinidade no Brasil, entre 1960 e 1975. Funcionaram de forma dispersa quando se estabeleceram no exterior, aproximadamente no período compreendido entre 1970 e 1979. Contém comunicados, textos e publicações mimeografadas, panfletos e correspondência relativos às organizações: Política Operária (PO), Organização Revolucionária Marxista Política Operária (POLOP), Partido Operário Comunista (POC), Movimento Revolucionário 8 de Outubro (MR-8), Vanguarda Armada Revolucionária Palmares (VAR-PALMARES), Ação Libertadora Nacional (ALN), Partido Comunista Brasileiro Revolucionário (PCBR) e Democracia Socialista (DS). Reúne também documentos relativos à campanhas internacionais de ajuda aos presos políticos, bem como periódicos das organizações e outros de temas afins.

O conjunto reúne livros, folhetos, periódicos, textos e correspondência que tratam dos acontecimentos históricos de seu interesse, como a Revolução Francesa, a Revolução Russa, o desenvolvimento da China, a história da Alemanha e, particularmente, a ascensão do nazismo. Da documentação, destaca-se a correspondência com Isaac Deutscher, seu amigo pessoal e biógrafo de Trotsky e Stalin, além de textos inéditos de sua autoria sobre a ascensão do nazismo e a revolução russa. Fitas cassetes com entrevistas e depoimentos do titular integram também o acervo. A biblioteca possui muitos títulos de Economia, Socialismo e Marxismo, História da Revolução Francesa, da Revolução Russa, além de história da China e da Alemanha.

A documentação reflete o interesse de Paulo Ottoni em compreender a inserção dos homossexuais na sociedade, bem como sua própria observação e militância no movimento homossexual. Reúne trabalhos acadêmicos sobre homossexualidade e prostituição masculina em Campinas, manuscritos, relatórios, documentação sobre assassinatos de homossexuais, cópia de processos criminais, material sobre o “I Encontro Brasileiro de Homossexuais” (1980), estudos, artigos de jornais e revistas, além de correspondência. Também inclui importante coleção de livros e periódicos sobre temas como homossexualidade, literatura e cinema.