Criado junto à Reitoria pela Portaria GR 59/85, de 28.03.1985, consolidou-se com a Deliberação do Conselho Universitário CONSU-A-026/1991, de 28.11.1991, que baixou o Regimento Interno do núcleo. Posteriormente foi vinculado à Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa – COCEN, de acordo com a Deliberação CONSU-A-17/98, de 29.09.1998. O Núcleo de Estudos Estratégicos tinha por objetivos a realização de estudos de natureza interdisciplinar, a participação sistemática no debate acadêmico nacional, a prestação de serviços e a divulgação de conhecimentos dirigidos para três áreas de pesquisa: Forças Armadas e Estado, Estratégia e Política Internacional. Foi extinto Pela Deliberação do Conselho Universitário – CONSU-347/09, de 25.11.2009, em que se determinou a constituição de uma comissão para avaliação da destinação do acervo e dos servidores do Núcleo.